Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKP1P63208 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKP1P63208 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKP1P63208 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKP1P63208 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKP1P63208 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKP1P63208 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SKP1P63208 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKP1P63208 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKP1P63208 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKP1P63208 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP1P63208 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP1P63208 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP1P63208 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP1P63208 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP1P63208 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP1P63208 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP1P63208 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP1P63208 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP1P63208 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP1P63208 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP1P63208 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP1P63208 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP1P63208 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP1P63208 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP1P63208 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP1P63208 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP1P63208 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP1P63208 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP1P63208 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP1P63208 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP1P63208 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP1P63208 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP1P63208 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP1P63208 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP1P63208 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP1P63208 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP1P63208 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP1P63208 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP1P63208 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP1P63208 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP1P63208 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP1P63208 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP1P63208 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP1P63208 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP1P63208 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP1P63208 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP1P63208 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP1P63208 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP1P63208 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP1P63208 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP1P63208 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP1P63208 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP1P63208 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP1P63208 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP1P63208 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP1P63208 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP1P63208 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP1P63208 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP1P63208 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP1P63208 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP1P63208 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP1P63208 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP1P63208 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP1P63208 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP1P63208 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP1P63208 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP1P63208 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP1P63208 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP1P63208 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP1P63208 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP1P63208 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP1P63208 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP1P63208 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP1P63208 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP1P63208 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP1P63208 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP1P63208 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP1P63208 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP1P63208 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP1P63208 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP1P63208 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP1P63208 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP1P63208 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP1P63208 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP1P63208 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP1P63208 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP1P63208 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP1P63208 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP1P63208 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP1P63208 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP1P63208 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP1P63208 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP1P63208 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP1P63208 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP1P63208 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP1P63208 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP1P63208 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP1P63208 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP1P63208 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms