Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms