Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms