Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNRPD1P62314 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNRPD1P62314 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPD1P62314 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPD1P62314 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPD1P62314 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPD1P62314 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPD1P62314 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms