Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF3P61204 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF3P61204 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF3P61204 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF3P61204 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF3P61204 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF3P61204 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF3P61204 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF3P61204 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF3P61204 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF3P61204 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF3P61204 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF3P61204 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF3P61204 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF3P61204 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF3P61204 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF3P61204 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF3P61204 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF3P61204 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF3P61204 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF3P61204 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF3P61204 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF3P61204 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF3P61204 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF3P61204 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF3P61204 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF3P61204 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF3P61204 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF3P61204 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF3P61204 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF3P61204 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF3P61204 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF3P61204 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF3P61204 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF3P61204 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF3P61204 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARF3P61204 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARF3P61204 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARF3P61204 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARF3P61204 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARF3P61204 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARF3P61204 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARF3P61204 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ARF3P61204 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARF3P61204 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARF3P61204 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARF3P61204 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARF3P61204 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF3P61204 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF3P61204 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF3P61204 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF3P61204 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF3P61204 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF3P61204 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF3P61204 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF3P61204 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF3P61204 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF3P61204 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF3P61204 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF3P61204 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF3P61204 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF3P61204 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF3P61204 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF3P61204 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF3P61204 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF3P61204 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF3P61204 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF3P61204 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF3P61204 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF3P61204 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF3P61204 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF3P61204 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF3P61204 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF3P61204 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF3P61204 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF3P61204 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF3P61204 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF3P61204 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF3P61204 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF3P61204 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF3P61204 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF3P61204 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF3P61204 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF3P61204 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF3P61204 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF3P61204 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF3P61204 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF3P61204 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARF3P61204 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARF3P61204 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF3P61204 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF3P61204 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF3P61204 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF3P61204 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF3P61204 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF3P61204 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF3P61204 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF3P61204 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF3P61204 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF3P61204 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms