Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR3P61158 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms