Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms