Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF3P57682 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF3P57682 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF3P57682 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF3P57682 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF3P57682 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF3P57682 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF3P57682 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF3P57682 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF3P57682 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF3P57682 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF3P57682 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF3P57682 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF3P57682 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF3P57682 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF3P57682 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF3P57682 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF3P57682 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLF3P57682 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLF3P57682 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLF3P57682 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF3P57682 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF3P57682 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF3P57682 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF3P57682 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF3P57682 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF3P57682 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF3P57682 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF3P57682 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF3P57682 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF3P57682 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF3P57682 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF3P57682 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF3P57682 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF3P57682 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF3P57682 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF3P57682 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF3P57682 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF3P57682 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF3P57682 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF3P57682 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF3P57682 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF3P57682 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF3P57682 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF3P57682 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF3P57682 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF3P57682 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF3P57682 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF3P57682 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF3P57682 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF3P57682 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF3P57682 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF3P57682 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF3P57682 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF3P57682 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF3P57682 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF3P57682 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF3P57682 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF3P57682 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF3P57682 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF3P57682 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF3P57682 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF3P57682 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF3P57682 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF3P57682 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF3P57682 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF3P57682 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF3P57682 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF3P57682 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF3P57682 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF3P57682 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF3P57682 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF3P57682 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF3P57682 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF3P57682 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF3P57682 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF3P57682 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF3P57682 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF3P57682 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF3P57682 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF3P57682 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF3P57682 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF3P57682 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF3P57682 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF3P57682 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF3P57682 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF3P57682 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF3P57682 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF3P57682 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF3P57682 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF3P57682 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF3P57682 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF3P57682 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF3P57682 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF3P57682 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF3P57682 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF3P57682 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF3P57682 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF3P57682 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF3P57682 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms