Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLTPP55058 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLTPP55058 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLTPP55058 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLTPP55058 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLTPP55058 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLTPP55058 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLTPP55058 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLTPP55058 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLTPP55058 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLTPP55058 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLTPP55058 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLTPP55058 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLTPP55058 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLTPP55058 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PLTPP55058 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLTPP55058 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLTPP55058 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLTPP55058 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PLTPP55058 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLTPP55058 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PLTPP55058 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLTPP55058 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLTPP55058 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLTPP55058 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLTPP55058 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLTPP55058 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLTPP55058 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLTPP55058 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLTPP55058 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLTPP55058 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLTPP55058 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLTPP55058 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLTPP55058 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLTPP55058 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLTPP55058 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLTPP55058 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLTPP55058 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLTPP55058 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLTPP55058 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLTPP55058 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLTPP55058 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLTPP55058 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLTPP55058 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLTPP55058 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLTPP55058 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLTPP55058 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLTPP55058 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLTPP55058 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLTPP55058 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLTPP55058 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLTPP55058 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLTPP55058 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLTPP55058 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLTPP55058 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLTPP55058 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLTPP55058 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLTPP55058 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLTPP55058 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLTPP55058 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLTPP55058 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLTPP55058 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLTPP55058 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLTPP55058 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLTPP55058 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PLTPP55058 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLTPP55058 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLTPP55058 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLTPP55058 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLTPP55058 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLTPP55058 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLTPP55058 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PLTPP55058 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLTPP55058 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLTPP55058 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLTPP55058 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLTPP55058 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLTPP55058 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PLTPP55058 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PLTPP55058 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLTPP55058 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLTPP55058 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLTPP55058 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLTPP55058 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLTPP55058 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLTPP55058 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLTPP55058 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLTPP55058 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLTPP55058 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLTPP55058 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLTPP55058 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLTPP55058 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLTPP55058 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLTPP55058 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLTPP55058 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLTPP55058 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLTPP55058 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLTPP55058 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLTPP55058 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLTPP55058 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms