Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms