Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK4P51957 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK4P51957 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK4P51957 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK4P51957 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK4P51957 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK4P51957 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK4P51957 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK4P51957 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK4P51957 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK4P51957 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK4P51957 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK4P51957 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK4P51957 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK4P51957 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK4P51957 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK4P51957 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK4P51957 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK4P51957 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK4P51957 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK4P51957 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK4P51957 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK4P51957 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK4P51957 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK4P51957 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK4P51957 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK4P51957 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK4P51957 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK4P51957 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK4P51957 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK4P51957 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK4P51957 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK4P51957 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK4P51957 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK4P51957 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK4P51957 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK4P51957 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK4P51957 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK4P51957 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK4P51957 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK4P51957 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK4P51957 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK4P51957 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK4P51957 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK4P51957 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NEK4P51957 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEK4P51957 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEK4P51957 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEK4P51957 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEK4P51957 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEK4P51957 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEK4P51957 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEK4P51957 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEK4P51957 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEK4P51957 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEK4P51957 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEK4P51957 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK4P51957 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK4P51957 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK4P51957 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK4P51957 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK4P51957 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK4P51957 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK4P51957 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK4P51957 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK4P51957 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK4P51957 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK4P51957 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK4P51957 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK4P51957 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK4P51957 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK4P51957 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK4P51957 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK4P51957 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK4P51957 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK4P51957 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK4P51957 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK4P51957 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK4P51957 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK4P51957 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK4P51957 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK4P51957 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK4P51957 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK4P51957 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK4P51957 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK4P51957 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK4P51957 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK4P51957 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK4P51957 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK4P51957 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK4P51957 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK4P51957 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK4P51957 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK4P51957 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK4P51957 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK4P51957 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK4P51957 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK4P51957 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK4P51957 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK4P51957 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms