Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK7P50613 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK7P50613 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK7P50613 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK7P50613 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK7P50613 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK7P50613 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK7P50613 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK7P50613 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK7P50613 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK7P50613 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK7P50613 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK7P50613 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK7P50613 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK7P50613 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK7P50613 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK7P50613 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK7P50613 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK7P50613 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK7P50613 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK7P50613 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK7P50613 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK7P50613 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK7P50613 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK7P50613 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK7P50613 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK7P50613 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK7P50613 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK7P50613 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK7P50613 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK7P50613 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK7P50613 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK7P50613 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK7P50613 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK7P50613 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK7P50613 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK7P50613 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK7P50613 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK7P50613 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK7P50613 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK7P50613 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK7P50613 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK7P50613 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK7P50613 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK7P50613 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK7P50613 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK7P50613 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK7P50613 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK7P50613 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK7P50613 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK7P50613 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK7P50613 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK7P50613 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK7P50613 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK7P50613 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK7P50613 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK7P50613 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK7P50613 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK7P50613 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK7P50613 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK7P50613 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK7P50613 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK7P50613 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK7P50613 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK7P50613 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK7P50613 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK7P50613 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK7P50613 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK7P50613 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDK7P50613 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK7P50613 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK7P50613 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK7P50613 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK7P50613 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK7P50613 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK7P50613 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK7P50613 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK7P50613 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK7P50613 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK7P50613 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK7P50613 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK7P50613 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK7P50613 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK7P50613 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK7P50613 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK7P50613 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK7P50613 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK7P50613 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK7P50613 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK7P50613 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK7P50613 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK7P50613 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK7P50613 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK7P50613 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK7P50613 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK7P50613 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK7P50613 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK7P50613 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK7P50613 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK7P50613 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms