Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTPAP49638 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTPAP49638 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TTPAP49638 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTPAP49638 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTPAP49638 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTPAP49638 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTPAP49638 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTPAP49638 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTPAP49638 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TTPAP49638 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTPAP49638 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TTPAP49638 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TTPAP49638 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TTPAP49638 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTPAP49638 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTPAP49638 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTPAP49638 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTPAP49638 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTPAP49638 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTPAP49638 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTPAP49638 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTPAP49638 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTPAP49638 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTPAP49638 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTPAP49638 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTPAP49638 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTPAP49638 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTPAP49638 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTPAP49638 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTPAP49638 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTPAP49638 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTPAP49638 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTPAP49638 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTPAP49638 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTPAP49638 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTPAP49638 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTPAP49638 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTPAP49638 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTPAP49638 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTPAP49638 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTPAP49638 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTPAP49638 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTPAP49638 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TTPAP49638 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTPAP49638 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTPAP49638 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTPAP49638 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTPAP49638 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTPAP49638 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTPAP49638 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTPAP49638 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTPAP49638 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTPAP49638 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTPAP49638 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTPAP49638 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTPAP49638 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTPAP49638 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTPAP49638 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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TTPAP49638 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTPAP49638 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTPAP49638 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTPAP49638 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTPAP49638 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTPAP49638 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TTPAP49638 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTPAP49638 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTPAP49638 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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TTPAP49638 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TTPAP49638 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TTPAP49638 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TTPAP49638 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTPAP49638 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTPAP49638 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTPAP49638 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTPAP49638 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTPAP49638 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTPAP49638 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTPAP49638 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TTPAP49638 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTPAP49638 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTPAP49638 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTPAP49638 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TTPAP49638 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTPAP49638 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTPAP49638 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTPAP49638 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTPAP49638 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTPAP49638 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTPAP49638 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTPAP49638 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTPAP49638 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTPAP49638 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTPAP49638 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTPAP49638 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTPAP49638 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTPAP49638 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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