Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC11A1P49279 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms