Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms