Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms