Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XCR1P46094 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XCR1P46094 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XCR1P46094 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XCR1P46094 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XCR1P46094 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XCR1P46094 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XCR1P46094 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XCR1P46094 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XCR1P46094 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XCR1P46094 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XCR1P46094 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XCR1P46094 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XCR1P46094 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XCR1P46094 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XCR1P46094 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XCR1P46094 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
XCR1P46094 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XCR1P46094 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XCR1P46094 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XCR1P46094 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XCR1P46094 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XCR1P46094 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
XCR1P46094 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XCR1P46094 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XCR1P46094 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XCR1P46094 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
XCR1P46094 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XCR1P46094 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XCR1P46094 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XCR1P46094 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XCR1P46094 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XCR1P46094 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XCR1P46094 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XCR1P46094 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XCR1P46094 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XCR1P46094 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XCR1P46094 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XCR1P46094 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XCR1P46094 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XCR1P46094 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XCR1P46094 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XCR1P46094 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XCR1P46094 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
XCR1P46094 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
XCR1P46094 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
XCR1P46094 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XCR1P46094 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XCR1P46094 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XCR1P46094 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XCR1P46094 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XCR1P46094 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
XCR1P46094 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XCR1P46094 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
XCR1P46094 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
XCR1P46094 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XCR1P46094 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XCR1P46094 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
XCR1P46094 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XCR1P46094 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
XCR1P46094 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XCR1P46094 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XCR1P46094 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XCR1P46094 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XCR1P46094 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XCR1P46094 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
XCR1P46094 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XCR1P46094 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XCR1P46094 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XCR1P46094 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XCR1P46094 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XCR1P46094 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XCR1P46094 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XCR1P46094 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XCR1P46094 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XCR1P46094 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XCR1P46094 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XCR1P46094 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XCR1P46094 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XCR1P46094 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XCR1P46094 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XCR1P46094 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XCR1P46094 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XCR1P46094 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XCR1P46094 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XCR1P46094 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XCR1P46094 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XCR1P46094 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XCR1P46094 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XCR1P46094 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
XCR1P46094 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XCR1P46094 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XCR1P46094 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XCR1P46094 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XCR1P46094 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XCR1P46094 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XCR1P46094 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XCR1P46094 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XCR1P46094 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XCR1P46094 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms