Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPR4P46093 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPR4P46093 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPR4P46093 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPR4P46093 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR4P46093 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR4P46093 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR4P46093 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR4P46093 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR4P46093 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR4P46093 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR4P46093 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR4P46093 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR4P46093 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR4P46093 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR4P46093 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR4P46093 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR4P46093 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR4P46093 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR4P46093 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR4P46093 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR4P46093 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR4P46093 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR4P46093 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR4P46093 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR4P46093 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR4P46093 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR4P46093 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR4P46093 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR4P46093 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR4P46093 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR4P46093 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR4P46093 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR4P46093 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR4P46093 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR4P46093 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR4P46093 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR4P46093 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR4P46093 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR4P46093 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR4P46093 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR4P46093 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR4P46093 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR4P46093 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR4P46093 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR4P46093 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR4P46093 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR4P46093 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR4P46093 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR4P46093 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR4P46093 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR4P46093 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR4P46093 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR4P46093 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR4P46093 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR4P46093 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR4P46093 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR4P46093 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR4P46093 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR4P46093 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR4P46093 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR4P46093 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR4P46093 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR4P46093 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR4P46093 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR4P46093 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR4P46093 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR4P46093 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR4P46093 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR4P46093 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR4P46093 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR4P46093 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR4P46093 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR4P46093 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms