Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAGEA1P43355 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms