Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL35P42766 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL35P42766 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL35P42766 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL35P42766 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL35P42766 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL35P42766 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL35P42766 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL35P42766 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL35P42766 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL35P42766 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL35P42766 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL35P42766 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL35P42766 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL35P42766 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL35P42766 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL35P42766 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL35P42766 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL35P42766 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL35P42766 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL35P42766 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL35P42766 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL35P42766 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL35P42766 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL35P42766 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPL35P42766 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPL35P42766 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPL35P42766 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPL35P42766 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPL35P42766 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL35P42766 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL35P42766 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL35P42766 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL35P42766 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL35P42766 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL35P42766 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL35P42766 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL35P42766 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL35P42766 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL35P42766 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL35P42766 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL35P42766 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL35P42766 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL35P42766 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL35P42766 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL35P42766 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL35P42766 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL35P42766 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL35P42766 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL35P42766 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL35P42766 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL35P42766 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL35P42766 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL35P42766 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL35P42766 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL35P42766 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL35P42766 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL35P42766 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL35P42766 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL35P42766 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL35P42766 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL35P42766 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL35P42766 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL35P42766 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL35P42766 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL35P42766 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL35P42766 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL35P42766 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL35P42766 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL35P42766 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL35P42766 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL35P42766 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL35P42766 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL35P42766 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL35P42766 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL35P42766 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL35P42766 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL35P42766 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL35P42766 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL35P42766 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL35P42766 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL35P42766 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL35P42766 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL35P42766 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL35P42766 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL35P42766 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL35P42766 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL35P42766 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL35P42766 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL35P42766 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL35P42766 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL35P42766 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL35P42766 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL35P42766 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms