Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA1P42261 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA1P42261 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA1P42261 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA1P42261 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA1P42261 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA1P42261 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GRIA1P42261 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIA1P42261 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms