Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL4P36578 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL4P36578 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL4P36578 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL4P36578 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL4P36578 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL4P36578 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL4P36578 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL4P36578 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL4P36578 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL4P36578 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL4P36578 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL4P36578 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL4P36578 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL4P36578 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL4P36578 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL4P36578 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL4P36578 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL4P36578 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL4P36578 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL4P36578 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL4P36578 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL4P36578 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL4P36578 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL4P36578 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL4P36578 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL4P36578 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL4P36578 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL4P36578 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL4P36578 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL4P36578 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL4P36578 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL4P36578 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPL4P36578 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
RPL4P36578 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL4P36578 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL4P36578 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL4P36578 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL4P36578 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL4P36578 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL4P36578 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL4P36578 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL4P36578 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL4P36578 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL4P36578 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL4P36578 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL4P36578 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL4P36578 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL4P36578 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL4P36578 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL4P36578 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL4P36578 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL4P36578 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL4P36578 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL4P36578 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL4P36578 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL4P36578 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL4P36578 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL4P36578 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL4P36578 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL4P36578 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL4P36578 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL4P36578 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL4P36578 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL4P36578 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL4P36578 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL4P36578 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL4P36578 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL4P36578 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL4P36578 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL4P36578 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL4P36578 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL4P36578 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms