Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD12P35452 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms