Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms