Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDI1P31150 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDI1P31150 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDI1P31150 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDI1P31150 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDI1P31150 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDI1P31150 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDI1P31150 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDI1P31150 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GDI1P31150 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDI1P31150 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDI1P31150 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDI1P31150 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDI1P31150 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDI1P31150 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDI1P31150 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDI1P31150 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDI1P31150 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDI1P31150 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDI1P31150 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDI1P31150 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDI1P31150 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDI1P31150 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDI1P31150 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDI1P31150 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDI1P31150 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDI1P31150 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDI1P31150 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDI1P31150 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDI1P31150 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDI1P31150 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDI1P31150 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDI1P31150 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GDI1P31150 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDI1P31150 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDI1P31150 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDI1P31150 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDI1P31150 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDI1P31150 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDI1P31150 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDI1P31150 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDI1P31150 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GDI1P31150 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDI1P31150 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDI1P31150 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDI1P31150 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDI1P31150 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDI1P31150 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDI1P31150 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDI1P31150 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GDI1P31150 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDI1P31150 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDI1P31150 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDI1P31150 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDI1P31150 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDI1P31150 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDI1P31150 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDI1P31150 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDI1P31150 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDI1P31150 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDI1P31150 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDI1P31150 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDI1P31150 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GDI1P31150 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDI1P31150 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDI1P31150 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDI1P31150 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GDI1P31150 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDI1P31150 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDI1P31150 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDI1P31150 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDI1P31150 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDI1P31150 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDI1P31150 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDI1P31150 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDI1P31150 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDI1P31150 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDI1P31150 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDI1P31150 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDI1P31150 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDI1P31150 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDI1P31150 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDI1P31150 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDI1P31150 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDI1P31150 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDI1P31150 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDI1P31150 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GDI1P31150 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDI1P31150 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDI1P31150 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDI1P31150 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDI1P31150 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDI1P31150 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDI1P31150 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDI1P31150 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDI1P31150 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDI1P31150 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDI1P31150 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDI1P31150 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDI1P31150 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms