Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TM4SF1P30408 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms