Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms