Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCAP28676 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCAP28676 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCAP28676 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCAP28676 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCAP28676 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GCAP28676 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCAP28676 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCAP28676 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GCAP28676 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCAP28676 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCAP28676 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCAP28676 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCAP28676 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCAP28676 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCAP28676 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCAP28676 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GCAP28676 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GCAP28676 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCAP28676 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCAP28676 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCAP28676 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCAP28676 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCAP28676 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCAP28676 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCAP28676 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCAP28676 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCAP28676 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCAP28676 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCAP28676 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCAP28676 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCAP28676 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCAP28676 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCAP28676 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCAP28676 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCAP28676 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCAP28676 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCAP28676 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCAP28676 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCAP28676 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCAP28676 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCAP28676 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCAP28676 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCAP28676 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCAP28676 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCAP28676 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCAP28676 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCAP28676 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCAP28676 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCAP28676 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCAP28676 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCAP28676 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCAP28676 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCAP28676 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCAP28676 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCAP28676 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCAP28676 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCAP28676 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCAP28676 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCAP28676 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCAP28676 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCAP28676 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCAP28676 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCAP28676 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCAP28676 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GCAP28676 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCAP28676 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCAP28676 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCAP28676 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCAP28676 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCAP28676 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCAP28676 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCAP28676 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCAP28676 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCAP28676 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCAP28676 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCAP28676 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCAP28676 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCAP28676 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCAP28676 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCAP28676 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GCAP28676 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCAP28676 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCAP28676 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCAP28676 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCAP28676 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCAP28676 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCAP28676 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCAP28676 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCAP28676 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCAP28676 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCAP28676 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCAP28676 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCAP28676 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCAP28676 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCAP28676 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCAP28676 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCAP28676 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GCAP28676 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCAP28676 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms