Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXP28300 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXP28300 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXP28300 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXP28300 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXP28300 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXP28300 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXP28300 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXP28300 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXP28300 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXP28300 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXP28300 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXP28300 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXP28300 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXP28300 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXP28300 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXP28300 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXP28300 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXP28300 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXP28300 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXP28300 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXP28300 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXP28300 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXP28300 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXP28300 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXP28300 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXP28300 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXP28300 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXP28300 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXP28300 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXP28300 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXP28300 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXP28300 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXP28300 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXP28300 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXP28300 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXP28300 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXP28300 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXP28300 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXP28300 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXP28300 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXP28300 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXP28300 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXP28300 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXP28300 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXP28300 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXP28300 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXP28300 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXP28300 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXP28300 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXP28300 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXP28300 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXP28300 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXP28300 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXP28300 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXP28300 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXP28300 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXP28300 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXP28300 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXP28300 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXP28300 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXP28300 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXP28300 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXP28300 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXP28300 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LOXP28300 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LOXP28300 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LOXP28300 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LOXP28300 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LOXP28300 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LOXP28300 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LOXP28300 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LOXP28300 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms