Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SSFA2P28290 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SSFA2P28290 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms