Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4BP23588 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms