Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA1P20827 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms