Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms