Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms