Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms