Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PDE6GP18545 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PDE6GP18545 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PDE6GP18545 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PDE6GP18545 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PDE6GP18545 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PDE6GP18545 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PDE6GP18545 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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