Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XBP1P17861 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XBP1P17861 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
XBP1P17861 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XBP1P17861 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XBP1P17861 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XBP1P17861 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XBP1P17861 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XBP1P17861 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XBP1P17861 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XBP1P17861 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XBP1P17861 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XBP1P17861 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XBP1P17861 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XBP1P17861 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XBP1P17861 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XBP1P17861 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XBP1P17861 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XBP1P17861 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XBP1P17861 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XBP1P17861 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XBP1P17861 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XBP1P17861 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XBP1P17861 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XBP1P17861 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XBP1P17861 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XBP1P17861 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XBP1P17861 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XBP1P17861 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XBP1P17861 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XBP1P17861 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XBP1P17861 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XBP1P17861 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XBP1P17861 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XBP1P17861 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XBP1P17861 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XBP1P17861 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XBP1P17861 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XBP1P17861 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XBP1P17861 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XBP1P17861 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XBP1P17861 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XBP1P17861 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XBP1P17861 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XBP1P17861 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XBP1P17861 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XBP1P17861 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XBP1P17861 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XBP1P17861 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XBP1P17861 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XBP1P17861 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XBP1P17861 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XBP1P17861 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XBP1P17861 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XBP1P17861 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XBP1P17861 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XBP1P17861 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XBP1P17861 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XBP1P17861 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XBP1P17861 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XBP1P17861 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XBP1P17861 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XBP1P17861 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XBP1P17861 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
XBP1P17861 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
XBP1P17861 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
XBP1P17861 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
XBP1P17861 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
XBP1P17861 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
XBP1P17861 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XBP1P17861 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XBP1P17861 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XBP1P17861 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XBP1P17861 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XBP1P17861 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XBP1P17861 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XBP1P17861 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XBP1P17861 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XBP1P17861 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XBP1P17861 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XBP1P17861 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XBP1P17861 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XBP1P17861 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XBP1P17861 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XBP1P17861 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XBP1P17861 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XBP1P17861 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XBP1P17861 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XBP1P17861 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XBP1P17861 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XBP1P17861 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XBP1P17861 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XBP1P17861 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XBP1P17861 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XBP1P17861 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XBP1P17861 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
XBP1P17861 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XBP1P17861 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XBP1P17861 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XBP1P17861 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms