Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPN2P17655 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms