Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms