Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFXP16104 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
H2AFXP16104 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
H2AFXP16104 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
H2AFXP16104 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
H2AFXP16104 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
H2AFXP16104 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2AFXP16104 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms