Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PRF1P14222 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRF1P14222 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PRF1P14222 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PRF1P14222 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRF1P14222 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PRF1P14222 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRF1P14222 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRF1P14222 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRF1P14222 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRF1P14222 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRF1P14222 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRF1P14222 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRF1P14222 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRF1P14222 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRF1P14222 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRF1P14222 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRF1P14222 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRF1P14222 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRF1P14222 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRF1P14222 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRF1P14222 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRF1P14222 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRF1P14222 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRF1P14222 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRF1P14222 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRF1P14222 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PRF1P14222 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRF1P14222 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRF1P14222 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRF1P14222 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRF1P14222 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRF1P14222 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRF1P14222 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRF1P14222 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRF1P14222 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRF1P14222 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRF1P14222 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRF1P14222 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PRF1P14222 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRF1P14222 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRF1P14222 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRF1P14222 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRF1P14222 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRF1P14222 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRF1P14222 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRF1P14222 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRF1P14222 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRF1P14222 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRF1P14222 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRF1P14222 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRF1P14222 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRF1P14222 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRF1P14222 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRF1P14222 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PRF1P14222 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRF1P14222 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRF1P14222 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRF1P14222 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRF1P14222 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRF1P14222 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRF1P14222 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRF1P14222 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRF1P14222 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRF1P14222 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRF1P14222 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRF1P14222 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRF1P14222 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRF1P14222 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRF1P14222 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRF1P14222 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRF1P14222 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PRF1P14222 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PRF1P14222 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRF1P14222 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRF1P14222 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRF1P14222 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRF1P14222 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRF1P14222 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRF1P14222 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRF1P14222 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRF1P14222 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRF1P14222 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PRF1P14222 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRF1P14222 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRF1P14222 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRF1P14222 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRF1P14222 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRF1P14222 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRF1P14222 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PRF1P14222 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRF1P14222 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRF1P14222 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRF1P14222 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PRF1P14222 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRF1P14222 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRF1P14222 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRF1P14222 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRF1P14222 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRF1P14222 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms