Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT13P13646 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT13P13646 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT13P13646 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT13P13646 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT13P13646 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT13P13646 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT13P13646 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT13P13646 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT13P13646 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT13P13646 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT13P13646 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT13P13646 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT13P13646 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT13P13646 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT13P13646 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT13P13646 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT13P13646 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT13P13646 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT13P13646 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT13P13646 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT13P13646 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT13P13646 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT13P13646 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT13P13646 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT13P13646 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT13P13646 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT13P13646 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT13P13646 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT13P13646 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT13P13646 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT13P13646 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT13P13646 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT13P13646 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT13P13646 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT13P13646 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT13P13646 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT13P13646 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT13P13646 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT13P13646 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT13P13646 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT13P13646 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT13P13646 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT13P13646 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT13P13646 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT13P13646 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT13P13646 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT13P13646 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT13P13646 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT13P13646 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT13P13646 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT13P13646 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT13P13646 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT13P13646 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT13P13646 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT13P13646 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT13P13646 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT13P13646 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT13P13646 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT13P13646 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT13P13646 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT13P13646 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT13P13646 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT13P13646 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT13P13646 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT13P13646 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT13P13646 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT13P13646 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT13P13646 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT13P13646 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT13P13646 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT13P13646 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT13P13646 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT13P13646 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT13P13646 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT13P13646 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT13P13646 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT13P13646 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT13P13646 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT13P13646 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT13P13646 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT13P13646 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT13P13646 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT13P13646 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT13P13646 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT13P13646 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT13P13646 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT13P13646 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT13P13646 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT13P13646 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT13P13646 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT13P13646 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT13P13646 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT13P13646 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT13P13646 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT13P13646 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT13P13646 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT13P13646 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT13P13646 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT13P13646 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms