Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DMDP11532 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DMDP11532 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DMDP11532 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DMDP11532 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMDP11532 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMDP11532 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMDP11532 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMDP11532 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMDP11532 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMDP11532 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMDP11532 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMDP11532 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMDP11532 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMDP11532 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMDP11532 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMDP11532 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMDP11532 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMDP11532 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMDP11532 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DMDP11532 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DMDP11532 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DMDP11532 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DMDP11532 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DMDP11532 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DMDP11532 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DMDP11532 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DMDP11532 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DMDP11532 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DMDP11532 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DMDP11532 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DMDP11532 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DMDP11532 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DMDP11532 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DMDP11532 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DMDP11532 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DMDP11532 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMDP11532 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMDP11532 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMDP11532 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMDP11532 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMDP11532 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMDP11532 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMDP11532 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMDP11532 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DMDP11532 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMDP11532 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMDP11532 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMDP11532 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMDP11532 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMDP11532 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMDP11532 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DMDP11532 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMDP11532 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMDP11532 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMDP11532 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMDP11532 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMDP11532 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMDP11532 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMDP11532 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMDP11532 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DMDP11532 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMDP11532 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMDP11532 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMDP11532 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMDP11532 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DMDP11532 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DMDP11532 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DMDP11532 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DMDP11532 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DMDP11532 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DMDP11532 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DMDP11532 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DMDP11532 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DMDP11532 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DMDP11532 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DMDP11532 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DMDP11532 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DMDP11532 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DMDP11532 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DMDP11532 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DMDP11532 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DMDP11532 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DMDP11532 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DMDP11532 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DMDP11532 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DMDP11532 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DMDP11532 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DMDP11532 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DMDP11532 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DMDP11532 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DMDP11532 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DMDP11532 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DMDP11532 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DMDP11532 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DMDP11532 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DMDP11532 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DMDP11532 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DMDP11532 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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