Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1P11387 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1P11387 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1P11387 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1P11387 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1P11387 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1P11387 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1P11387 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1P11387 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1P11387 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1P11387 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1P11387 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP1P11387 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP1P11387 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP1P11387 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP1P11387 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP1P11387 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP1P11387 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP1P11387 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP1P11387 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP1P11387 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP1P11387 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP1P11387 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP1P11387 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP1P11387 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP1P11387 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP1P11387 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1P11387 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1P11387 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1P11387 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1P11387 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1P11387 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1P11387 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1P11387 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1P11387 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1P11387 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1P11387 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1P11387 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1P11387 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1P11387 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TOP1P11387 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TOP1P11387 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TOP1P11387 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TOP1P11387 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TOP1P11387 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1P11387 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1P11387 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1P11387 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1P11387 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1P11387 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1P11387 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1P11387 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1P11387 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1P11387 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1P11387 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1P11387 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1P11387 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1P11387 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1P11387 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1P11387 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1P11387 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1P11387 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1P11387 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1P11387 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1P11387 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1P11387 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1P11387 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1P11387 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOP1P11387 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOP1P11387 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOP1P11387 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOP1P11387 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOP1P11387 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOP1P11387 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOP1P11387 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TOP1P11387 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOP1P11387 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOP1P11387 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP1P11387 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP1P11387 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP1P11387 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP1P11387 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP1P11387 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP1P11387 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP1P11387 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP1P11387 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP1P11387 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP1P11387 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP1P11387 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP1P11387 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP1P11387 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP1P11387 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP1P11387 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP1P11387 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP1P11387 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP1P11387 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP1P11387 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP1P11387 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP1P11387 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP1P11387 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms