Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms