Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HKR1P10072 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HKR1P10072 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HKR1P10072 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HKR1P10072 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HKR1P10072 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HKR1P10072 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HKR1P10072 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HKR1P10072 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HKR1P10072 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HKR1P10072 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HKR1P10072 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HKR1P10072 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HKR1P10072 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HKR1P10072 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HKR1P10072 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HKR1P10072 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HKR1P10072 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HKR1P10072 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HKR1P10072 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HKR1P10072 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HKR1P10072 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HKR1P10072 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HKR1P10072 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HKR1P10072 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HKR1P10072 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HKR1P10072 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HKR1P10072 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HKR1P10072 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HKR1P10072 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HKR1P10072 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HKR1P10072 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HKR1P10072 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HKR1P10072 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HKR1P10072 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HKR1P10072 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HKR1P10072 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HKR1P10072 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HKR1P10072 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HKR1P10072 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HKR1P10072 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HKR1P10072 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HKR1P10072 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HKR1P10072 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HKR1P10072 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HKR1P10072 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HKR1P10072 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HKR1P10072 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HKR1P10072 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HKR1P10072 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HKR1P10072 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HKR1P10072 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HKR1P10072 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HKR1P10072 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HKR1P10072 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HKR1P10072 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HKR1P10072 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HKR1P10072 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HKR1P10072 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HKR1P10072 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HKR1P10072 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HKR1P10072 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HKR1P10072 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HKR1P10072 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HKR1P10072 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HKR1P10072 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HKR1P10072 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HKR1P10072 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HKR1P10072 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HKR1P10072 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HKR1P10072 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HKR1P10072 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HKR1P10072 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HKR1P10072 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HKR1P10072 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HKR1P10072 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HKR1P10072 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HKR1P10072 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HKR1P10072 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HKR1P10072 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HKR1P10072 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HKR1P10072 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HKR1P10072 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HKR1P10072 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HKR1P10072 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HKR1P10072 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HKR1P10072 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HKR1P10072 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HKR1P10072 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HKR1P10072 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HKR1P10072 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HKR1P10072 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HKR1P10072 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HKR1P10072 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HKR1P10072 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HKR1P10072 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HKR1P10072 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HKR1P10072 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HKR1P10072 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HKR1P10072 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms