Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM225BP0DP42 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms