Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms