Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms