Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM200BP0CF97 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms